育成医療および更生医療を行うために必要な設備（頭部X線規格写真撮影装置など）および体制（矯正歯科を標榜し、大学病院の矯正歯科などで5年以上研究従事実績があることなど）を有していることが求められます。指定医療機関で治療を受けると、更生医療・育成医療の給付が受けられます。更生医療・育成医療の給付は、口唇裂・口蓋裂のような咀嚼や発音など日常生活に支障をきたす症例の治療に適用されます。

顎口腔機能診断機器を有しているなど、顎口腔機能診断施設基準に適合している医療機関のみが認可されます。下顎運動検査または舌接触運動検査のいずれか一方と、咀嚼筋筋電図測定が行える機器を有し、専任の常勤歯科医師と歯科衛生士が各1名以上勤務し、かつ、外科手術を行う口腔外科などと連携体制が整備されていることが求められます。

①「厚生労働大臣が定める疾患」に起因した咬合異常

②前歯3歯以上の永久歯萌出不全に起因した咬合異常（埋伏歯開窓術を必要とするものに限る）

③顎変形症（顎離断等の手術を必要とするものに限る）

　厚生労働大臣が定める先天異常の疾患

1. 唇顎口蓋裂
2. ゴールデンハー症候群（鰓弓異常症を含む。）
3. 鎖骨頭蓋骨異形成
4. トリーチャ・コリンズ症候群
5. ピエール・ロバン症候群
6. ダウン症候群
7. ラッセル・シルバー症候群
8. ターナー症候群
9. ベックウィズ・ウイーデマン症候群
10. 顔面半側萎縮症
11. 先天性ミオパチー
12. 筋ジストロフィー
13. 脊髄性筋委縮症
14. 顔面半側肥大症
15. エリス・ヴァンクレベルド症候群
16. 軟骨形成不全症
17. 外胚葉異形成症
18. 神経線維腫症
19. 基底細胞母斑症候群
20. ヌーナン症候群
21. マルファン症候群
22. プラダー・ウィリー症候群
23. 顔面裂（横顔裂、斜顔裂及び正中顔裂を含む。）
24. 大理石骨病
25. 色素失調症
26. 口腔・顔面・指趾症候群
27. メビウス症候群
28. 歌舞伎症候群
29. クリッペル・トレノネー・ウェーバー症候群
30. ウイリアムズ症候群
31. ビンダー症候群
32. スティックラー症候群
33. 小舌症
34. 頭蓋骨癒合症（クルーゾン症候群及び尖頭合指症を含む。）
35. 骨形成不全症
36. フリーマン・シェルドン症候群
37. ルビンスタイン・ティビ症候群
38. 染色体欠失症候群
39. ラーセン症候群
40. 濃化異骨症
41. 6歯以上の先天性部分無歯症
42. CHARGE症候群
43. マーシャル症候群
44. 成長ホルモン分泌不全性低身長症
45. ポリエックス症候群（XXX症候群、XXXX症候群及びXXXXX症候群を含む。）
46. リング18症候群
47. リンパ管腫
48. 全前脳胞症
49. クラインフェルター症候群
50. 偽性低アルドステロン症
51. ソトス症候群
52. グリコサミノグリカン代謝障害（ムコ多糖症）
53. 線維性骨異形成症
54. スタージ・ウェーバ症候群
55. ケルビズム
56. 偽性副甲状腺機能低下症
57. Ekman-Westborg-Julin症候群
58. 常染色体重複症候群
59. その他顎・口腔の先天異常
    「その他顎・口腔の先天異常」とは、顎・口腔の奇形、変形を伴う先天性疾患であり、当該疾患に起因する咬合異常について、歯科矯正の必要性が認められる場合に、その都度当局に内議の上、歯科矯正の対象とすることができる